Der Protonierungsgrad von Asp85 bestimmt die Orientierung der Seitenkette von Arg82, [ 10 ] weil Asp85 durch die Protonierung neutralisiert wird und damit die Salzbr cke mit Arg82 bricht.
Dessen Seitenkette bewegt sich daraufhin auf Glu194/Glu204 zu (Schritt 2 in Abbildung 1a).
Diese Bewegung destabilisiert einen protonierten Wassercluster zwischen Arg82, Glu194 und Glu204 – die Protonenabgabegruppe (Schritt 3 in Abbildung 1a) –, und das darin gespeicherte Proton wird an das extrazellul re Medium abgegeben.[11,12] Die exakte Beschreibung der Protonenabgabegruppe ist dabei immer noch Gegenstand aktueller Diskussionen.
www.bph.ruhr-uni-bochum.deDuring the L to M transition, the protonated Schiff base ( C = NH + ), the central proton-binding site, deprotonates and protonates its counterion Asp85 [ 9 ] ( step 1 in Figure 1a ).
Protonation of Asp85 breaks its salt bridge to Arg82, which then moves towards Glu194/Glu204 (step 2).
The orientation of Arg82 depends on the protonation state of Asp85.[10] The arginine movement destabilizes a protonated water cluster between Arg82, Glu194, and Glu204 (step 3 in Figure 1a), and a proton is released to the bulk.[11,12] However, the detailed nature of the proton-release group is still under debate.
www.bph.ruhr-uni-bochum.deIm Molekül muß ein Ringsystem mit mindestens einer Doppelbindung vorliegen.
Der Doppelbindung benachbart muß eine Seitenkette vorhanden sein.
Es wird eine Karboxylgruppe benötigt, die durch ein oder zwei C-Atome vom Ringsystem getrennt ist.
www.biologie.uni-hamburg.deThe molecule has to contain a ring system with at least one double bond.
The double bond has to be adjacent to a side chain.
A carboxyl group that is separated by one or two C-atoms is required.
www.biologie.uni-hamburg.deDasselbe gilt für das Paar Thr80 und Arg85.
Die Seitenkette von Arg85 greift über die Untereinheitengrenze in Richtung beider Sauerstoffatome des Threonin.
Außer den polaren gibt es hydrophobe Wechselwirkungen für den Zusammenhalt der Untereinheiten.
www.biologie.uni-hamburg.deThe same holds for the pair Thr80 and Arg85.
The side chain of Arg85 contacts both oxygen atoms of the threonine across the subunit interface.
Besides polar interactions there are hydrophobic contacts responsible for the sticking of the subunits.
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