Im Jahr 2004 wurde unser Proteomforschungslabor in Kooperation mit dem MPI für Biogeochemie und dem Hans-Knöll-Institut, die beide auch auf dem Beutenberg Campus angesiedelt sind, eingerichtet.
Das ProtLab bietet Serviceleistungen für die Proteinidentifizierung mittels 1D- und 2D-Gelelektrophorese und Massenspektrometrie an.
Üblicherweise werden Proben mit einem hybriden Q-TOF HDMS Synapt Massenspektrometer mit höchster Massengenauigkeit gemessen, das Daten liefert, die für eine de novo Sequenzierung von Peptiden / kleinen Polypeptiden nicht sequenzierter Organismen genutzt werden können.
www.ice.mpg.deIn 2004 our proteomic facility ( ProtLab ) was established in cooperation with the MPI for Biogeochemistry and the Hans Knöll Institute, both located on Beutenberg Campus.
ProtLab provides services in 1D and 2D-gel electrophoresis and mass-spectrometry based protein identifications.
Typically samples are measured on a hybrid Q-TOF HDMS Synapt instrument with a high mass accuracy providing data usable for de novo sequencing of peptides / small polypeptides from non-sequenced organisms.
www.ice.mpg.deIod wurde außerdem als interner Standard für Gewebeschnitte verwendet.
Zusätzlich wurden Pt-Protein Komplexe mit 1D und 2D Gelelektrophorese getrennt und mit LA-ICP-MS analysiert.
Die hohe räumliche Auflösung dieser Technik wurde anhand der Detektion von platinierten Proteinen in Rattennierengewebe auch in einer aktuellen Studie zur Toxizität von Cisplatin und dem daher notwendigen Schutz der Niere unter Beweis gestellt.
www.bam.deIodine was also applied as a new internal standard for tissue samples.
Moreover, Pt-protein complexes separated by an optimized 1D and 2D gel electrophoresis were analyzed by LA-ICP-MS.
The high spatial resolution of this technique was further demonstrated in a current study of cisplatin toxicity and renal protective strategies in rat kidney tissue by detecting platinated proteins.
www.bam.deWie die Durchfluss-Zytometrie hilft auch die Mikroskopie, die Proteinaktivität auf zellularer Ebene quantitativ zu bestimmen, da mit ihr viele Zellen gleichzeitig über einen längeren Zeitraum beobachtet werden können.
Die 2D-Gelelektrophorese ermög licht die Trennung und Identifizierung von Molekülen anhand der Geschwindigkeit, mit der sie sich durch ein elektrisches Feld bewegen.
Diese Technik wird, neben rein analytischen Zwecken, auch zur Reinigung von Molekülen genutzt, bevor weitere Methoden wie zum Beispiel Massen spektrometrie, PCR, Klonierung, DNA-Sequenzierung oder ‚ Immuno-Blotting ’ angewendet werden.
www.mathworks.deLike flow cytometry, microscopy helps quantify protein activity at a cellular level by capturing images of multiple cells over time.
Two-dimensional gel electrophoresis enables researchers to separate and identify molecules based on their speed of movement through an electrically charged field.
This technique is performed for analysis or to partially purify molecules before applying other methods, such as mass spectrometry, PCR, cloning, DNA sequencing, or immunoblotting.
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